Der Sensor hat kein Bayer-Pattern (mit 2x2-Pixel-Matrix) wie fast alle anderen Sensoren der anderen Kamerahersteller, sondern das Fuji-X-Trans-Pattern, bei dem sich die Farben in einer 6x6-Matrix wiederholen, außerdem ist in jeder Matrix ein grünempfindliches Pixel mit der vierfachen Fläche der anderen Pixel vorhanden. Moiré soll so ohne Anti-Aliasing-Filter vor dem Sensor vermieden werden, außerdem wird das Rauschen bei höheren Empfindlichkeiten verringert.
Die X-M1 basiert im weiten Teilen auf der X-E1, jedoch wurden aus Kostengründen etliche Funktionen und Bauteile eingespart, so gibt es keinen Videosucher und kein klassisches Zeitenrad, verbessert wurde aber auch einiges: WLAN und einen Klappmonitor hat die X-E1 nicht.
Zusammen mit der X-M1 wurden preiswerte Setobjektive entwickelt, die leichten und kompakten XC-Objektive bestehen fast vollständig aus Kunststoff, haben keinen Blendenring und auch keinen Schalter, um die eingebaute Bildstabilisierung abzustellen. Auch das optische Design ist vereinfacht, Rest-Bildfehler wie Verzeichnung und Vignettierung muß der Kameraprozessor beseitigen.